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根据《财政部 国家税务总局关于增值税税控系统专用设备和技术维护费用抵减增值税税额有关政策的通知》(财税〔2012〕15号)规定，企业每年向航天信息或百旺金赋缴纳技术维护费，取得增值税普通发票的，可以全额抵减增值税。
企业取得研发过程中形成的下脚料、残次品、中间试制品等特殊收入，在计算确认收入当年的加计扣除研发费用时，应从已归集研发费用中扣减该特殊收入，不足扣减的，加计扣除研发费用按零计算。
免税单位无偿使用纳税单位的土地，该宗土地免税单位与纳税单位均不需缴纳，但是免税单位无偿使用纳税单位的房产，相当于纳税单位无偿出借房屋，由于借入方是免税单位，因此由纳税单位按照房产余值计征房产税。
航空企业实际发生的飞行员养成费、飞行训练费、乘务训练费、空中保卫员训练费等空勤训练费用，根据《实施条例》第二十七条规定，可以作为航空企业运输成本在税前扣除。
当年有注销分支机构的情况，注销的分支机构应自办理注销税务登记之日起不再就地分摊缴纳企业所得税，并且调整分配比例。年度终了汇算清缴时，按调整后的分配比例计算现有分支机构应补和应退税款。
金融商品转让、经纪代理服务、融资租赁和融资性售后回租业务、航空运输业务、一般纳税人提供客运场站服务、旅游服务、建筑服务、销售自行开发的房地产项目、转让不动产、劳务派遣服务、人力资源外包服务等适用差额征税。
由于房产税属于地方税种，对于已投入使用但未竣工决算的房产原值确认依据各地执行口径不一，建议企业实务操作中应以当地主管税务机关的要求为准。
在一个纳税年度内，纳税人发生的与基本医保相关的医药费用支出，扣除医保报销后个人负担(指医保目录范围内的自付部分)累计超过15000元的部分，由纳税人在办理年度汇算清缴时，在80000元限额内据实扣除。
