案例：

A公司于2025年1月7日从B公司购进一批原材料，取得的增值税专用发票上注明的价款为300000元，增值税税额为39000元。按照购销合同规定，A公司应于2025年8月1日前向B公司支付款项。但由于A公司发生财务困难，一直没能支付款项。在2025年11月10日，经双方协商进行债务重组，债务重组协议规定，B公司同意少收取A公司50000元，剩余289000元款项于签订债务重组协议之日一次付清。

那么，A公司已抵扣的进项税额由于债务重组，是否还要计算分离出来少支付的进项税额，并做进项税额转出呢?

分析：

《中华人民共和国增值税暂行条例》第十条规定，下列项目的进项税额不得从销项税额中抵扣：

(一)用于简易计税方法计税项目、免征增值税项目、集体福利或者个人消费的购进货物、劳务、服务、无形资产和不动产；

(二)非正常损失的购进货物，以及相关的劳务和交通运输服务；

(三)非正常损失的在产品、产成品所耗用的购进货物(不包括固定资产)、劳务和交通运输服务；

(四)国务院规定的其他项目。

《财政部 国家税务总局关于全面推开营业税改征增值税试点的通知》(财税〔2016〕36号)附件1：《营业税改征增值税试点实施办法》第二十七条规定，下列项目的进项税额不得从销项税额中抵扣：

(一)用于简易计税方法计税项目、免征增值税项目、集体福利或者个人消费的购进货物、加工修理修配劳务、服务、无形资产和不动产。其中涉及的固定资产、无形资产、不动产，仅指专用于上述项目的固定资产、无形资产(不包括其他权益性无形资产)、不动产。

纳税人的交际应酬消费属于个人消费。

(二)非正常损失的购进货物，以及相关的加工修理修配劳务和交通运输服务。

(三)非正常损失的在产品、产成品所耗用的购进货物(不包括固定资产)、加工修理修配劳务和交通运输服务。

(四)非正常损失的不动产，以及该不动产所耗用的购进货物、设计服务和建筑服务。

(五)非正常损失的不动产在建工程所耗用的购进货物、设计服务和建筑服务。

纳税人新建、改建、扩建、修缮、装饰不动产，均属于不动产在建工程。

(六)购进的旅客运输服务、贷款服务、餐饮服务、居民日常服务和娱乐服务。

(七)财政部和国家税务总局规定的其他情形。

本条第(四)项、第(五)项所称货物，是指构成不动产实体的材料和设备，包括建筑装饰材料和给排水、采暖、卫生、通风、照明、通讯、煤气、消防、中央空调、电梯、电气、智能化楼宇设备及配套设施。

从上面增值税暂行条例和财税〔2016〕36号文件规定的进项税额不允许抵扣的具体项目看，并没有规定因为债务重组，少支付的进项税额不允许抵扣这一项目。但这两个文件都有一个兜底的规定，即国务院规定的其他项目，也就是财政部和国家税务总局规定的其他不允许抵扣的情形。而到目前为止，财政部和国家税务总局并没有下发因为债务重组，少支付的进项税额不允许抵扣的文件。因此，债务重组，少支付的进项税额可以抵扣，无需进行转出。