对于房屋和土地一并转让的情况，是否可以分别缴纳增值税，这是一个在实务中非常重要且常见的问题。总的原则是：通常情况下，房屋和土地使用权一并转让时，应视为一项完整的销售行为，合并缴纳增值税，而不能人为地分割为两项交易分别纳税。以下是详细的解释和分析：

一、核心原则：房地一体原则

我国的房地产税收和产权管理遵循“房地一体”原则，即“房随地走、地随房走”。当您转让建筑物或构筑物时，其占用范围内的土地使用权一并转让；反之，转让土地使用权时，地上的建筑物也一并转让。在增值税上，这一原则同样适用。根据《财政部 国家税务总局关于全面推开营业税改征增值税试点的通知》（财税〔2016〕36号）附件1《营业税改征增值税试点实施办法》的规定，销售不动产是指转让不动产所有权的行为。而不动产，是指不能移动或者移动后会引起性质、形状改变的财产，包括建筑物、构筑物等，以及与其不可分割的土地使用权。因此，将房屋和土地打包一并转让，在税法上被视为 “销售不动产” 这一项应税行为，而不是“销售房产”和“销售土地使用权”两项行为。

二、为什么不能随意分别缴纳？

如果允许纳税人随意将一并转让的房产和土地分割开来、分别计算缴纳增值税，会带来以下问题：一是侵蚀税基：纳税人可能会通过人为操纵房产和土地的评估价格，将利润转移到税率较低或免税的部分（例如，将价格向土地使用权倾斜，因为转让土地使用权可能涉及不同的税收政策），从而达到少缴增值税的目的。二是违背交易实质：在正常的市场交易中，房屋和土地的价值是密不可分的。单独的土地或悬在空中的房屋都没有独立的使用价值和市场价值。分别计价不符合经济实质。三是征管复杂化：会给税收征管带来巨大的困难和漏洞，增加税务机关的核查成本。

三、特殊情况与处理方式

尽管原则上是合并纳税，但在某些特定情况下，处理方式会有所不同，但这并非纳税人主动选择的“分别缴纳”，而是税法对不同性质收入的规定：

情况一：纳税人分别核算不同性质的资产。如果一个纳税人同时拥有并准备转让多宗资产，其中既包括与房屋一并转让的土地，也包括单独转让的土地使用权，那么他需要分别核算：销售不动产：房屋连同土地一并转让，按“销售不动产”适用税率/征收率（如9%，或5%的征收率）纳税。销售无形资产：如果仅仅是转让单独的土地使用权（不附带地上建筑物），则按“销售无形资产”中的“自然资源使用权（土地使用权）”适用税率/征收率纳税。在这种情况下，纳税人是就不同的应税行为分别纳税，而不是将同一笔交易强行拆分。

情况二：房地产开发企业销售自行开发的房地产项目。对于房地产开发企业，其销售自行开发的房地产项目（新房），是作为一个整体项目按照“销售不动产”来缴纳增值税的，不允许将房价和地价拆分出来分别纳税。地价在计算增值税时，可以作为扣除项目（一般计税方法下）。

对于非房地产企业转让不动产（包括房屋及其土地）：一般纳税人：如果取得该不动产的时间在2016年4月30日前，可以选择适用简易计税方法，按照5%的征收率全额纳税，或按差额（全部价款减去取得原价）依5%征收率纳税。如果取得时间在2016年5月1日后，通常采用一般计税方法，以取得的全部价款和价外费用为销售额，按9%的税率计算销项税额（其取得不动产时对应的增值税进项税额可以抵扣），土地价款不得抵减销售额。小规模纳税人适用简易计税方法，以取得的全部价款和价外费用为销售额，按5%的征收率计算纳税。

总而言之，对于“房屋和土地一并转让”这一项交易，必须合并作为“销售不动产”来缴纳增值税，而不能由纳税人主观决定将其分为房屋和土地两部分分别缴税。